Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BC035947B2RQY6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BC035947B2RQY6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms