Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r5B2RQT2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r5B2RQT2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms