Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Mbd5B1AYB6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Mbd5B1AYB6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd5B1AYB6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd5B1AYB6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd5B1AYB6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Mbd5B1AYB6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd5B1AYB6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd5B1AYB6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd5B1AYB6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mbd5B1AYB6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms