Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spocd1B1ASB6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spocd1B1ASB6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spocd1B1ASB6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms