Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grik3B1AS29 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grik3B1AS29 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms