Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprsB0V2N1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprsB0V2N1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprsB0V2N1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprsB0V2N1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprsB0V2N1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprsB0V2N1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprsB0V2N1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprsB0V2N1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprsB0V2N1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprsB0V2N1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms