Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M5A7VMS3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2-M5A7VMS3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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