Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prr16A3KMN5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr16A3KMN5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr16A3KMN5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms