Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm6880A3KG45 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6880A3KG45 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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