Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Palm3A2TJV2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Palm3A2TJV2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Palm3A2TJV2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms