Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf39A2RT81 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf39A2RT81 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms