Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
4931406B18RikA2RSL7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms