Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syndig1A2ANU3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syndig1A2ANU3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms