Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GabreA2AMW3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GabreA2AMW3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GabreA2AMW3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms