Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc183A2AJB1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc183A2AJB1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms