Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Hmcn2A2AJ76 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hmcn2A2AJ76 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms