Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc163A2AGD7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms