Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ube2dnl2A2AFH2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ube2dnl2A2AFH2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms