Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmem185aA2AF53 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem185aA2AF53 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms