Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700023F06RikA2AB62 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms