Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C87977A2A958 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C87977A2A958 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C87977A2A958 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C87977A2A958 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C87977A2A958 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms