Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc112A0AUP1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc112A0AUP1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms