Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPC5

Zfp109, Zinc finger protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp109A0A0U1RPC5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfp109A0A0U1RPC5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp109A0A0U1RPC5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp109A0A0U1RPC5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp109A0A0U1RPC5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp109A0A0U1RPC5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfp109A0A0U1RPC5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp109A0A0U1RPC5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp109A0A0U1RPC5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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