Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A0U1RNP2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0U1RNP2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms