Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY38

Ighv1-42, Immunoglobulin heavy variable V1-42 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ighv1-42A0A0A6YY38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms