Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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