Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Vstm4T1NXB5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vstm4T1NXB5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms