Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Homer1Q9Z2Y3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Homer1Q9Z2Y3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Homer1Q9Z2Y3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms