Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdac6Q9Z2V5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdac6Q9Z2V5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
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