Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms