Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Robo3Q9Z2I4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Robo3Q9Z2I4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms