Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn8Q9Z260 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn8Q9Z260 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms