Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl8Q9Z121 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl8Q9Z121 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms