Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp2Q9Z0Z3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms