Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Nup160Q9Z0W3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Nup160Q9Z0W3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nup160Q9Z0W3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms