Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itsn1Q9Z0R4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itsn1Q9Z0R4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms