Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slfn1Q9Z0I7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms