Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Extl3Q9WVL6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Extl3Q9WVL6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms