Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacsin2Q9WVE8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pacsin2Q9WVE8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.9 ms