Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd6ipQ9WU78 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms