Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pus1Q9WU56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pus1Q9WU56 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms