Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scnn1bQ9WU38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Scnn1bQ9WU38 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scnn1bQ9WU38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms