Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skp1Q9WTX5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skp1Q9WTX5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms