Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp18Q9WTV6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp18Q9WTV6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp18Q9WTV6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp18Q9WTV6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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