Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nfe2l3Q9WTM4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nfe2l3Q9WTM4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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