Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam50bQ9WTJ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam50bQ9WTJ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam50bQ9WTJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms