Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cry2Q9R194 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms