Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Wdr54Q9R0D8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms