Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AmfrQ9R049 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AmfrQ9R049 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AmfrQ9R049 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms