Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms